欢迎来到公海赌船Nature发文!生物医学研究院陈飞团队揭示转录与基因组稳定性“双重质控”新机制陈飞团队正在剖判INTAC的卵白互作质谱结果时觉察●,INTAC与一个单链DNA识别复合物SOSS(Sensor of Single-Strand DNA)存正在异常强的彼此效用。SOSS正在之前的探索中被觉察紧要正在DNA damage repair中起效用●●。探索者通过一系列体外里的生物化学以及基因组学等实行本领证据了SOSS-INTAC复合物正在染色质上的安宁存正在。
进一步的探索觉察,SOSS-INTAC复合物紧要团结正在基因的启动子区域。SOSS中的ssDNA识别卵白会诱导SOSS-INTAC与ssDNA团结●●,并督促SOSS-INTAC复合物正在染色质上的招募及发扬转录早期终止的功效●●。机制探索解释,SOSS-INTAC正在染色质上的团结依赖于R-loop布局中的ssDNA●●。识别R-loops之后,SOSS-INTAC通过其RNA核酸内切酶效用诱导转录早期终止,同时协同RNA核酸外切酶exosome和XRN2●,防备R-loops的太过蕴蓄堆积,从而竣工保卫基因组安宁性的功效●●。最终,探索者还觉察SOSS-INTAC正在细胞内以生物大分子凝集体的形状存正在●●,而且这种凝集体被伤害后会明显影响SOSS-INTAC调控R-loops和基因组安宁性的本领。
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综上所述欢迎来到公海赌船,该探索论文初次审定了一个基因转录和基因组安宁性调控复合物SOSS-INTAC,并揭示了其正在基因转录调控和基因组安宁性保卫中的“双重质控”功效,是基因转录与基因组安宁叉探索范畴的又一打破性觉察●●。
2023年8月9日,复旦大学生物医学探索院/从属肿瘤病院陈飞课题组与浙江大学陆华松课题组配合,正在Nature杂志以长文形状发布了作品R-loop dependent promoter-proximal termination ensures genome stability (《R-loop依赖的启动子近端转录早期终止保卫基因组安宁性》)。该探索初次觉察了INTAC复合物与单链DNA识别复合物SOSS安宁团结并造成SOSS-INTAC复合物;该复合物以凝集体的形状通过调控细胞内R-loop的秤谌保卫基因组安宁性。
SOSS-INTAC的做事模子●。SOSS-INTAC通过SOSS所具有的ssDNA识别本领●,以生物大分子凝集体的形状通过识别转录进程发作的R-loop布局中的ssDNA将INTAC招募至染色质上,发扬基因转录早期终止的功效;SOSS-INTAC与RNA核酸外切酶exosome和XRN2协同,压制染色质上R-loops太过蕴蓄堆积,从而保卫细胞内的基因组安宁性●●。
基因转录进程中发作的再生RNA(nascent RNA)可能与翻开的双链DNA中的模板链产生碱基互补配对,造成RNA:DNA杂交链。RNA:DNA杂交链与未配对的单链DNA(single-strand DNA, ssDNA)所造成的三链核酸布局被称为R-loop。R-loops布局安宁,寻常富集于Pol II产生较高秤谌暂停的启动子区域以及活泼外达的基因上。已有探索解释新闻动态●,R-loop的十分累积会对基因组安宁性形成宏大要挟。一方面,R-loop中显现的ssDNA极易受到诱变剂和核酸酶的攻击;另一方面,R-loop会遏制复制叉前行,诱发转录与复制冲突。所以,R-loop秤谌的精准调控也是保卫基因组安宁性的主要质控合节。然而●●,行为转录进程中通常发作的副产品●,人们对待基因转录呆板怎么调控R-loop秤谌和保卫基因组安宁性的机制并不显露●●。
原题目:《Nature发文!生物医学探索院陈飞团队揭示转录与基因组安宁性“双重质控”新机制》
上等生物中,由RNA集结酶II (Pol II)介导的转录是一个高度动态的进程,囊括了转录肇始、启动子近端暂停、延迟和终止等步调。已毕转录肇始的Pol II会正在转录肇始位点 (TSSs) 下逛200 bp的窗口内产生短暂暂停,并面对两种运气挑选——走向有用延迟(productive elongation)或者正在启动子左近产生转录早期终止(promoter-proximal premature termination)。此中,前者由卵白激酶复合物P-TEFb调控,它能有用督促基因的转录激活;后者由包蕴磷酸酶活性的INTAC复合物调控,会导致该轮转录进程的提前终止●。所以,转录呆板正在启动子区域的运气抉择●●,被以为是上等生物中基因转录调控的重心步调之一,也是转录精准调控的要害质控合节●●。然而,比拟于人们对P-TEFb介导的有用延迟的饱满认知●,INTAC介导转录早期终止的调控机制仍存正在良众未解之谜。
复旦大学从属肿瘤病院博士后徐从玲(即将入职同济大学性命科学与工夫学院,独立PI)●●,浙江大学性命科学探索院20级直博生李呈瑜,复旦大学生物医学探索院原博士后、复旦大学从属肿瘤病院助理探索员陈吉伟,复旦大学生物医学探索院21级直博生熊燕为本探索合伙第一作家。复旦大学生物医学探索院/从属肿瘤病院陈飞探索员和浙江大学陆华松探索员为合伙通信作家。